| Латинское название вируса | Arracacha mottle virus |
| Русское название вируса | Вирус крапчатости арракачи |
| Количество фрагментов в полном геноме | 1 |
| Общая длина генома (п.н.) | 9630 |
| Количество белков | 1 (нарезается на 17) |
Классификация [1]:
Описан в 1979. Зафиксирован в Перу, Бразилии и Боливии. РНК-содержащий вирус. Передается через семена, но точный механизм процесса неизвестен. В экспериментах легко заражает растения через инъекции сока. Имеет широкий круг хозяев (в экспериментах), но в природе найден только у арракача (Arracacia xanthorrhiza; зонтичные) и картофеля (Solanum tuberosum; пасленовые). Так как данные растения являются важными агрокультурами в Южной Америке, вирус наносит большой ущерб сельскому хозяйству стран этого континента. Вызывает образование желтых пятен на листьях (отсюда и название) и некроз тканей. Штамм ОСА (штамм O) и штамм Т отличаются по симптомам. Вирусные частицы изометрической формы, 26 нм в диаметре, с гексагональным профилем. Подробная структура частиц не известна.[2]
Белковая последовательность (полибелок, который затем нарезаетcя на 17 белков вируса):
| >YP_006522440.1 polyprotein Arracacha mottle virus MKANINHKANEFLSSQAIKQSKFQSFSISDNPMASALEIFQGYF EMDTFCVGQITCGYLTPRVEPVTPETVVTEMTIDAAGQLVEKTPLIEINEEKVEKAFA GLEKQLAQQFERRSTSKIVKTAKGHYRYRHLSDRAHMKVCAKKEQLCNEERAFQMAPP VTPETVVTEMTIDAAGQLVVKYPWREAQATSKRMKERIVRKKIALDEAGFKKLLKDLR KIMQEKQMNLEVVAKRQVRCAFAQFGKHSRLKIHTKHEDGVKNKIDLRIDPRCIPIIC DLAKGAGWGCAIQSNLLARGASGFVLKPDLIKVAHSRYKDNIFVVRGMSEGKLYDARV KITLHVVMSMTHFSSSDKYWKGYTRSWELIKADTNHHCEAHYSIENCGEVGALLTQIF IPSGKITCDMCARAVPDSIGHKYKDMVRHRLLDLDPIIAQNISHHKGFETAIAHIKGM VKVNKRNDAIFEQVFKQIGNLRKEPFIGLNKLNEFLYKGSSATEEDWEEARQTLLTIT RHMKDFVDAAKHGDISQFRNKMPSKVANNEFITCTHQLDKNAGFIWGQREPHAKRFFN NYYKQLDPSKGYGAYEVRKNPNGIRKLAIKSLIVSMNLHEFRQKMRGEFHKQPPLSTR CVGRLEGSYIHNCSCITNDDGSAFETPMYVPTRDQLVVGTSTDPRHIDLPKPQDENLL MVEDGYCYINIFIAMLVNVREEMAKDFTKMVRDEIIPKLGKWPSLSDVATTCAQLRII FPTVYNAVLPRILVDHDLQMCHVLDSYGSLTSGYHVLRVVTVNHLIAFANEDLESEIK FYRVGGDFKGENKYQHQEDSAISMLIKGVYRPHLLHDVLEMEPHLLLLSILSPTVVIA LYNNKHFDEALKLWLRKDQSISQMLLVLKTLAKKLSVAESLQAQMQLIETCTPSIRSI LYMGPHTEHSYVLALQMIERLANRKETNQVIRDLGYIDFANSAQSIIEKSYADQLEAS WHALSLSEKCSATYRSLQHKEDTTQWLRRLRRKDLKVPLSSSVIAYCGRMRTSAKGLV ENSYSRTRGYIRDTMRKSLVIMLRSTVRLFPFIEICTNVAVVLGVFIQVSIVGKKILT YYTKDKEELCNLKEDRMAQACKALHIALSKALGRDPTLQEYFDYLGLMSKELEEFARD QLQDMVEHQKSTLEVQKLEQIIAFVVLVFMMFDAERSDCIFKTLNKLKGVVATMDRQV EHQSLDDIVDTFELKNEVIHFDLEDEIKVPHVNNQKTFRQWWSNQIDNSRTLPHYRTE GAFMEFTRARAAAVASDIAHSDGLDFLIRGAVGSGKSTGLPSCLSKFGRVLLIEPTRP LAENVHRQLSSDPFFLKPTLRMHGVNVFGSSPISIMTSGFAFHYFAHNPMQLEDYNFV IFDECHVIDASAMAFRSLLHEHHSGVKLLKVSATPPGRETDFQTQHPVEIIIEESASH NAFVSALGSGSNLDVLRKGFNILVYVASYNEVDTLSNLLVNKGYMVTKVDGRTMKHGS VEVNTKGRKGKPHFIVATNIIENGVTLDIDTVVDFGTKVSPYLDVDNRCIVYNKHSIS FGERIQRLGRVGRFKPGVAVRIGHTEKGLVEIPTMIATEAALLCFAYNLPVMTANVSQ SLVDMCTIQQVRTMHHFEITPFFMVNFVANDGSMHPAIHDLLKKFKLRDSEIPLREKS IPYTASTMWMTAKEYERIGHRTGLHEDTRIAFGAKDIPSRLHEELWECVQQYKSSSMF SSLPRSCISKVAYTLKTDVYSISRTLGFIELLRENELEKQAQFRNLATDSFTSHFSML GLLNAARSSRMVDHTRDNLDRLENIKNQPLEYHNLRDSVNQTDLITKFEALQFVHHQS TNDLSKAIGLKGVWNKKLLARDLIIAAGVVAGGSWIVYECFKQKVTRVMHQGKSSNKK RRIKELRFKNARNNQIERIMNDDDTTMAEYFGSAYTAKGKQGGRTKGMGKKNRTFISM YGFEPTEYSYIKFMDPLTGKVIEENTIYADMQAVADEFAAERTRLMEADELDFETHRN RQTINAFFMKDGNTRKALKVDMTPHDAFKVCKNKATIAGLPERQGEFRQTGEAKEVNL SDYPSIVDHESQTLLKGLRDFNPVSQVVCKLTNESDGHVTTLYGVGFGPYIIANQHLF TRNNGCLKVTSHHGTFVMPNTTQIQVSPCSQRDIVIIKMPKDFPVFPRKLKFREPVDG ERVCMVGTNFQERYLSSTVSESSAVHPIRSSHFWKHWVSTKNGDCGLPFVAVSDGALV GIHSLGSTSERENYFVAFDNEFSEKMKLTPEQMQWERHWKYNANNVCWGGLVLKDNQP NGMFQPIKALQDLSKDILDFVGFQSKESRWMLEVLEDNLKAVAQLPSQLVTKHVVKGE CALFRTYLNVVAEAREFFEPKMHAYGKSKLNREAYIKDLMKYAQPITVGVVNTDDFDE AVSRVILYMRQRGFKECTYVTDHTEIFRSLNMKAAVGAMYGGKKADYFSKYTEEDKER ILYESCERLFLGKMGVWNGSLKAELRSKEKIEANKTRTFTAAPIDTLLAGKVCVDDFN NQFYSMNLNCCWTVGMTKFYGGWNTLLSQLPEGWVYCDADGSRFDSSLTPYLINAVLA IREAFMEEWDIGWHMLRNLYTEIIYTPISAADGTVLKKFRGNNSGQPSTVVDNSLMVV LAMHYSFIRNGIPFEDFEKVCRFFVNGDDLLIAVEPSHEHILDNMAAQFSELGLNYDF SSRTRSREDLWFMSHCGISVEGQYIPKLEEERIVSILQWDRATLPEHRLEAICAAMVE AWGYPELLYQIRKFYAWVLTQAPYSDLALEGKAPYIAETALRKLYTGTDASSEEIQVY LRAFSEIDDEIECGGFEVFHENQHSLVYHQGDNQTVDAGKSKVSSSLTPPTTLLSSGD QEEGKQLKKVKNDRDVDAGSSGAFSVPRLKGLSEKMRLPRIAGRNLLNLNHLLTYMPD PEELYNTRATHEQLNTWYEAIKREYDVGDDGLGIMLNGFMVWCIENGTSPNLNGEWTM MDGDEQVTYPLRPIVENAQPTLRQIMAHFSDAAEAYIVMRNAKEPYMPRYGLKRNLRD KSLARFMFDFYVITSKTPDRAREAHLQTKAAALRTTQNKMFGLDGSVGNSEESTERHT SEDVNSNLHSLMGVRNM |
Источники:
[1] Глобальная база данных EPPO (https://gd.eppo.int/taxon/AMOV00)
[2] Описание вирусов растений (http://www.dpvweb.net/dpv/showdpv.php?dpvno=270)
Вернуться на заглавную страничку
© Борисов Евгений 2015